フリーソフトでもできますが
コ マンドラインで暗号化できるようなので実施し てみます。
ファイル右クリックで圧縮したZIPファイルだと暗号化に失敗するようです...

zipコマンド引数で設定可能。

> zip -e [ZIPファイル名] [圧縮対象ファイル名]
Enter password: ***********
Verify password: ***********
encrypting: [ZIPファイル名]